选择防潮性，气密性和兼顾性良好的包装材料，就目前来说，选择聚乙烯塑料袋为内包装，厚纸箱为外包装为好。
干质后的香菇含水量在13%以下，用手轻掰菇柄容易折断，并发出清脆的响声，但也不宜太干，否则容易破碎。
干香菇宜吸湿回潮，烘干后如果不妥善贮藏，很容易反朝，特别是在雨季，气温高，湿度大的情况下，更易引起霉变及虫蛀。所以，必须在香菇烘干后六小时之内分等级装入大塑料袋中，封严带口。也可根据客户要求按等级，重量分装在塑料袋里，封严带口，再装进纸箱。
为了进一步提高干香菇的附加值，还可以给成品干香菇进行分级，精包装。选菇工人要给分级后的一级香菇进行更加细致的甄选。用人工一个个的将香菇内外形不符合精包装标准的畸形菇、残缺菇和各类杂质挑出。然后按标准给分检出的优质香菇称重、装袋。
检验员将装好袋的香菇再次复称重量，达到重量标准后，用自动封口机封口。通过金属检测器检验，确定合格后装箱，封箱后入库贮藏或装车销售。
干香菇必须在低温通风处贮存，密封的干香菇应放在15度下避光保存，在一度至五度下住藏效果更好，有条件的可把包装好香菇置于冰箱或冷库中贮存。
