接种室、发菌室在同一地方，大规模生产，通常是在温室内。使用前7-10天打扫干净。温室内要撒生石灰灭菌、除湿。
温室地面铺上塑料薄膜后，将栽培集袋移入温室准备接种。接种时间最好安排在晚上和早晨进行，接种人员要搞好个人卫生，技术熟练。先在栽培袋一侧打三个孔，把菌种迅速接入口内。另一侧，打两个口，再放入菌种。
接种好的栽培袋，习惯把它叫成菌棒，最后在菌棒上再套上一个塑料袋，用绳子扎紧，防止外来杂菌侵染接种孔。从此以后，花菇进入到了发菌管理阶段。
从接种到菌棒，达到生理成熟全过程。需要90天左右。花菇是恒温发菌、变温出菇的菌类。整个发菌期要求基本恒温24摄氏度左右，相对适度在60%至70%。
接种后温室要遮阴，最好在温室外覆盖上遮阳网，并且遮上草帘以遮挡阳光。接种后10左右进行第一次翻堆，以后隔10左右再翻堆一次，共反对4至5次。头两次翻堆一定要轻拿轻放，以后几次翻堆手法可以加重，增强刺激。
接种后20天左右，当接种孔香菇菌丝圈直径6-7厘米时。可以将套在菌棒上面的第一层塑料袋解开去掉，以利于菌丝的生长。
50天以后，花菇的白色菌丝基本上布满了全袋，此时可以进行刺孔通气了。刺孔通气的工具，就是这种带着许多钢钉的拍子。用这样的拍子拍打蓖棒，每个菌棒基本上要拍100个孔左右，深度在1.5厘米为好。在经过10左右的培养，菌棒就要转移到其它温室进行转色期的管理了。
